> もとのjavascriptファイル上の関数で用いたい場合
「もとのjavascriptファイル上の関数」が何を指すかによって変わってきます。

1.「javascriptファイル」が外部ファイルの場合
外部ファイルを直接書き換えることは不可能です。
ただし、外部ファイルに記述された関数に引数として値を渡すことは可能です。

↓PHP 部分
<?php

$foo = $_POST['foo'];
?>

↓HTML 部分
<script>
userFunction( <?php echo $foo; ?> );
</script>

などとすることで、PHP の変数を javascript の変数として渡すことができます。
PHP はサーバー側で HTML を生成してクライアントに返すので、最終的にどんな HTML になればよいかを考えていけば分かりやすいのではないでしょうか。

2.「もとの」が指すものが POST 先ではなく POST 元の場合
既に画面が遷移してしまっているので、POST 先の画面から POST 元の画面に対して新しい値を POST し直す必要があります。

a.php
↓ POST送信
b.php
↓ 新しい値を生成
↓ 新しい値をPOST送信
a.php

と言うような流れです。
HTML の submit を使わず、PHP から直接 POST する方法は下記URLを参考にして下さい。
http://weble.org/2011/03/07/php-get-and-POST-function

その他、jQuery の ajax 通信を利用して画面遷移せずに POST 先の PHP から値を取得する方法が考えられます。
http://semooh.jp/jquery/api/ajax/jQuery.ajax/options/
https://gihyo.jp/dev/feature/01/jquery-ajax

jQuery などのJavaScript ライブラリを使いたくない場合は、POST の target 先を 同じ PHP 内の iframe に指定する方法があります。
iframe に表示する PHP は POST 先の PHP です。
その POST 先 PHP 内の HTML 部分に

window.onload = window.parent.POST元javaScript関数 (<?php echo $foo; ?>);

と記述して POST 元の関数を呼び出すなどの方法が考えられます。
※iframe の width と heigth を 0px にしておけば、画面上では見えません。

他のトゥーイン用ライブラリとかでもあるのですが、

トゥーイン用ライブラリならトゥーイン用ライブラリで１つにしたい気がします。

あちこち使うと把握していない問題によって効率が悪くなると思うので・・・

現時点ではトゥーイン用ならBetweenAS3かなーと思っていたりします。
（http://www.libspark.org/wiki/BetweenAS3/en）

いずれにしてもありがとうございました。

ちょっと悩ましいのでhydrotikでGlowだけは使わないことにしました・・・ｗ
とはいうものの、何とか解決したいのはしたいですね。

このページのサンプルswfのためのflaファイルとライブラリのファイルでは
このコードで正常に動作しているのでしょうか＞？見せていただくことはムリですか？

もしかしたら、以下の記事とも関係あるかもしれないですね。
HydroTween.go colorプロパティtweenの仕様

が、Glow_blurのところの効果だけがどうしても再現できませんでした。全体にエラーはありません。

それまでの効果が適用されているのでインスタンス名はあっていますし、

HydroTween.asの中のコードを確認しましたが使い方もあっているようです。

どのあたりをうたがっていくべきでしょう？

Windows7Pro, Flash CS3 Pro